有机肥料除本身能提供氮、磷、钾、微量元素等营养元素外，有机肥腐熟分解产生的有机酸能溶解土壤中的磷，并减少磷肥和微量元素在土壤中的固定，因而提高了土壤中磷及微量元素的有效性。
基肥以有机肥为主，化肥为辅。有机肥主要有羊粪、牛马圈粪、油渣、豆饼和人尿粪等。有机肥不仅可以改良土壤、提高肥力，而且作用时间长。
基肥的施用方法主要有环状沟施、半环状沟施和条状沟施三种。
环状沟施：在树冠边缘下方，挖深30厘米，宽40厘米的环状施肥沟。
半环状沟施：在树冠边缘下方，挖1/2~2/3圆周长的弧形施肥沟，沟深30厘米，宽40厘米，翌年沟的位置换到原沟的对面。
条状沟施：在树冠边缘两侧各挖一条施肥沟，沟的深度和宽度同上，来年沟的位置换到另外两侧。
基肥以秋施为好，枸杞老产区都有10月份施基肥的习惯。秋施基肥的好处是：①此时枸杞树地上部已开始落叶，逐步进入休眠，挖断了的根系对树体影响不大;②秋施有机肥比春施腐熟早，有利根系早日吸收;③若能施入部分速效肥，则可在当年吸收，有利树体内养分积累，提高树体内营养水平，增强抗寒能力，对翌年生长结果都很有利。如果秋施基肥来不及，则应在翌年春季早施，同时配合一部分速效肥，以便早日发挥肥效作用。二、追肥施用技术
追肥是在枸杞生长结果期间增施速效肥，以弥补基肥的不足。它以速效化肥为主，腐熟的人粪尿为辅。对于化肥，其中氮肥有尿素、硫酸铵、硝酸铵、和碳酸氢铵等;磷肥有过磷酸钙、磷酸铵、磷酸二氢钾等;钾肥有硫酸钾、氯化钾等。另外还有氮磷钾等多元复合肥，是一种很好的枸杞用肥。宁杞1、2号及大果枸杞的培育者宁夏农林科学院钟鉎元研究员经多年试验发现，在施氮磷肥的基础上增施钾肥，能促进枸杞树对土壤养分的吸收，有利于树体生长发育。
追肥时期，应根据树体生长结果情况而定。4月下旬至5月上旬是枸杞新枝叶生长和老眼枝花蕾形成期，需追第一次肥，主要用氮肥，配合适量磷肥;6月初至7月底是一年中大量新枝生长、花蕾形成和开花结果高峰期，也是大量果实膨大生长最旺盛的时期，需要有充足的氮、磷、钾肥，若肥料不足，就会影响生长和加重落花落果。据陈桂松和熊志勋等人的施肥示踪试验，6月至8月，枸杞一年生枝中的氮、磷、钾含量均呈"V"形分布，证明7月份树体最缺肥，因此应在6月初和7月初各追一次氮、磷、钾复合肥。如果8月上旬枸杞新枝生长多，并有不少花蕾，为了促进秋果生长，此时还应再追一次氮钾肥。三、有机肥与化肥配合施用技术
有机肥含有多种营养元素，经济易得，来源广泛，但养分含量不高，肥效缓长，施用量大，因此在配方施肥中，要强调有机肥料与化肥配合施用，起到相互补充、相互促进的作用。一般地，化学氮肥可促进有机氮的矿化，提高有机肥料的肥效，而有机肥料可促进化学氮肥的生物固定，减少无机氮肥的硝化及反硝化作用，从而减少无机氮的损失。有机肥料除本身能提供氮、磷、钾、微量元素等营养元素外，有机肥腐熟分解产生的有机酸能溶解土壤中的磷，并减少磷肥和微量元素在土壤中的固定，因而提高了土壤中磷及微量元素的有效性。
在有机肥料与化肥配合施用技术中，有机肥一般以基础为主，追肥为辅，而化肥则以追施为主，基施为辅。从来源方便，经济效果好的角度考虑，枸杞园施用有机肥以猪粪、鸡粪、羊粪、各种饼肥和厩肥为宜。但这些肥料作追肥时必须进行腐熟才能使用，并且添加一定数量的化肥，才最有利于枸杞根系尽快吸收并发挥作用。通过以上的介绍，我们现在知道了枸杞怎么施肥，施肥就是要不断增加土壤中的养分，为枸杞创造良好的生长环境条件，促进树体旺盛生长，增强抵御病虫的能力，使枸杞生长好、花多、果多、产量高、质量优，常见的施肥方法有施基肥和追肥两种。
